Program doktor tersebut akan melengkapi prodi-prodi yang ada pada pascasarjana: S2 Ekonomi Syariah, S2 Manajemen Pendidikan Islam, S2 Hukum Keluarga Islam (Ahwal Syakhshiyyah), S2 Pendidikan Guru Madrasah Ibtidaiyah, S2 Pendidikan Agama Islam dan S2 Studi Islam.
Sementara, Team asesor Kemenag RI, Ahmad Thib Raya, menilai bahwa IAIN Kudus mampu dan layak memiliki Program Doktor.
Dirinya berharap adanya program S3 tersebut akan memunculkan cendikiawan – cendikiawan dan ilmuan yang keluar Program Doktor yang ada di IAIN Kudus.
Di lain sisi, Kasubdit Pengembangan Akademik Direktorat Pendidikan Tinggi Keagamaan Islam Direktorat Jenderal Pendidikan Islam, Abdullah Faqih sangat mendukung adanya Program studi doktor di IAIN Kudus.
“Harapan kami, hal itu semakin sungguh-sungguh dalam menyelenggarakan prodinya ,” harapnya.**
